Единоличным исполнительным органом МБУ ДО «Спортивная школа имени Макарова» является руководитель (директор), который осуществляет текущее руководство деятельностью Учреждения. В учреждении формируются коллегиальные органы управления, к которым относятся Общее собрание работников Учреждения, Педагогический совет.
Директор совместно с органами коллегиального управления Учреждением определяет стратегию и основные направления развития , объединяет усилия всех участников образовательных отношений на повышение эффективности образовательной деятельности, развитие и совершенствование образовательного процесса, повышения профессионального мастерства и творческого роста педагогических работников , укрепления и развития материально – технической базы Учреждения, создание оптимальных условий для осуществления образовательной деятельности. Общее собрание является постоянно действующим органом коллегиального управления, формируется из числа всех работников учреждения и действует неопределенный срок. Педагогический совет является постоянно действующим органом коллегиального управления, осуществляет информационно – аналитическую работу, определяет педагогические задачи, основные направления образовательной деятельности и методической работы школы, пути повышения качества образовательного процесса и обеспечения его соответствия федеральным государственным стандартам.
Филиалов и структурных подразделений МБУ ДО «Спортивная школа имени Макарова» не имеет.
